采收后的切花放置在2-5℃的环境下进行预冷包装（降低植株的田间热）。根据花苞的成熟情况、植株的长度、坚硬程度、叶片和花苞的受损程度以及花苞的数量进行分级10支/扎包装。包装好的整把花底部根剪齐套袋继续插水进行保鲜处理（预冷和保鲜处理的时间不得低于2个小时）。

百合经过保鲜处理后，根据品种的不同存放在2-5℃冷库。可以根据品种和采收的成熟情况进行一段时间的存放。

百合应包装在带孔的盒子中，以利于释放乙烯。运输时应保持2℃-3℃的低温。